在臨床上約40％-75％急性HCV感染者無任何不適症狀，只有血清ALT升高患者在求治其他疾病或體檢時才被意外發現，或因有輸血史、注射史，就醫時由於醫生警惕性高，檢測出抗-HCV 陽性和ALT升高而被發現。臨床表現一般較輕，被稱為亞臨床型。有一半患者可自行康復。但再次暴露於HCV後，又會重新感染。
感染HCV後，會出現周身不適、乏力、食慾減退、偶有噁心，少數患者有肝區疼痛，黃疸等典型急性肝炎的症狀。但總的來說，出現黃疸的病例很少，即使有黃疸也相對較輕。ALT可正常或僅僅有輕度升高，部分患者ALT持續升高。
一般將其分為3個型別：
1、反覆發作型：
此型為典型的HCV感染表現。ALT高於正常值，在正常值上下反覆波動，時高時低，緩解期時ALT可恢復正常，肝活檢結果表明，患者肝炎病變的嚴重程度不等。
2、持續異常型：
此型的ALT呈持續性升高，但ALT的數值僅比正常值高1-2倍左右。肝活檢同樣顯示病變輕重程度不等的慢性肝炎改變。持續型和反覆發作型，在急性期和慢性期感染均可見到。
3、健康攜帶型：
此型ALT正常，肝活檢可能正常或顯示不同程度的慢性肝炎改變。由於健康攜帶者仍可能存在病毒血症，所以ALT正常並不能否定慢性丙型肝炎的可能。
部分病例常與乙型肝炎病毒重疊感染，症狀較單純丙型肝炎感染重。感染的嚴重程度往往與輸多份血、輸血量大、輸入的血中肝炎病毒複製活躍有關，接受血者有可能患急性肝壞死或亞急重型肝炎，預後差，病死率高。
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