儘管外科手術仍然被推薦為早期肝癌的首選根治性性措施，然而，射頻消融治療早期肝癌的臨床療效得到越來越多的研究所認可，對於單發肝癌，直徑≤5cm，或多發腫瘤但數目在3個或以下，且最大瘤體直徑≤3cm的肝癌患者，射頻消融與外科切除術的1年，2年，3年和5年生存率基本相似，且射頻消融創傷小，恢復快，併發症發生率低，術後住院時間短，也越來越為患者所接受。根據近年來國際學術期刊發表的研究論文顯示，符合前述適應症的肝癌射頻消融後1年生存率87％~97.5％；2年生存率76.5％~91.2％；3年生存率69.6％~82.5％；5年生存率分別為54.8％~79.3％。
有些研究結果顯示，對於早期肝癌射頻消融術後複發率高於根治性外科手術切除，然而多數已發表的關於射頻消融與外科切除術治療原發性肝癌的對照研究都存在選擇性偏倚。入選射頻消融的患者的肝功能儲備（包括更低的血清白蛋白，更高的總膽紅素，PT延長，ICG-15R降低）較入選根治性肝癌切除術的患者相對較差。與接受外科手術的肝癌患者相比，接受射頻消融的患者往往血小板計數更低，AST、ALT更高，和更高的ALP（鹼性磷酸酶）。這些不良因素顯然對肝癌患者的與其生存有著顯著影響。國外學者採用傾向得分匹配法研究對比了極早期肝癌分別接受外科切除術治療和射頻消融治療後的1、2、3年和5年生存率和複發率並沒有統計學差異。多因素方差分析結果顯示，年齡＞65歲（HR 1.988），低白蛋白血癥（HR 1.751），總膽紅素（TBIL)＞27μmol/L （HR 2.032），PT/INR ＞1.1（HR 2.114），AFP＞20ng/ml （HR 1.680），多發腫瘤 （HR 1.851）是肝癌患者不良預後的獨立危險因素*（HR 為相對危險度）*，而外科手術和RFA 對於肝癌預後不是獨立影響因素。換言之，影響患者生存期的不是外科切除或射頻消融兩種治療措施，而是肝癌患者自身的臨床特徵。
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