目前一些醫療單位對就診患者或前來諮詢的人員常規進行HPV檢測，一般應用試劑盒檢測(核酸雜交法或是基因晶片法)，可以同時對幾十種HPV(包括低危型和高危型)一次性檢測。某些醫生對患者的病史、接觸史、臨床症狀和體徵漠不關心，隨意篩查HPV，一旦查出低危型HPV，不管患者有沒有症狀，就診斷為尖銳溼疣;如果檢測出高危型HPV，就告訴患者會得宮頸癌，有的醫生在檢測出HPV之後，給予患者過度的抗病毒和所謂的提高免疫力治療，包括輸液、打針、吃藥、區域性用藥和理療等等，給患者和家屬帶來巨大的精神壓力，造成巨大的經濟損失。
其實，HPV檢測的意義非常侷限，且不說檢測試劑盒的質量如何(不規範的試劑盒檢測結果會有假陽性)，即便是正規的試劑盒，檢測出低危型HPV並不等於得了尖銳溼疣，尖銳溼疣的診斷主要是根據接觸史和臨床表現來確定。
而宮頸癌的發生更是多種因素共同作用的結果，對於30歲以上宮頸癌的高危人群(如有家族史、長期口服避孕藥或接受放射線照射、機體免疫力低下、合併單純皰疹病毒或鉅細胞病毒感染等等)，可以定期進行HPV的檢測，追蹤觀察，與常規細胞學檢查(巴氏塗片)一起應用，來提高宮頸癌篩查的敏感性。
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