藍色尿可見於霍亂、斑疹、傷寒以及原發性高血鈣症和維生素D中毒者。另外，這種藍色尿與服用某些藥物有關，如使用氨苯喋啶、亞甲藍、靛卡紅、木榴油、水楊酸之後均可出現，停藥後可消失。
綠色尿見於尿內有綠膿桿菌滋生時，或膽紅素尿放置過久，氧化成膽綠素所致。淡綠色原有時也可因大量服用消炎痛所致。
黑色尿比較少見，常常發生於急性血管內溶血的病人，如惡性瘧疾病人，醫學上稱黑熱尿，是惡性瘧疾最嚴重的併發症之一。這種病人的血漿中含有大量的遊離氧、血紅蛋白與高鐵血紅蛋白，隨尿排出而造成尿呈暗紅或黑色。另有少數病人服用左旋多巴、甲酚、苯肼等藥物後，也會引起排黑色尿，停藥後即會消失。
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