環氧酶抑制劑對血液系統最主要的影響是抗凝。非選擇性環氧酶抑制劑抑制血小板環氧合酶-1，減少血栓素A2釋放，抑制血小板聚集，其與抗凝劑或阿司匹林聯用會明顯延長出血時間。阿司匹林需在術前7~10天停藥以便血小板功能得到恢復。小劑量阿司匹林是降低心血管疾病發生風險的常用方法。
幾乎所有的環氧酶抑制劑都可以引起再生障礙性貧血及粒細胞減少。保泰鬆、吲哚美辛及雙氯芬酸發生再生障礙性貧血的危險度分別為8.7、12.7和8.8，保泰鬆、吲哚美辛及雙氯滅痛導致再生障礙性貧血的危險程度較其它同類藥高。應用環氧酶抑制劑者出現貧血時首先應考慮胃腸道出血或失血，環氧酶抑制劑導致骨髓抑制罕見。維生素K缺乏者、血友病患者以及原有肝臟疾病者慎用或禁用。
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