研究顯示，對於HBsAg陽性妊娠女性的新生兒，即使進行乙肝疫苗和乙肝免疫球蛋白(HBIG)聯合免疫，仍有5％~15％的新生兒阻斷失敗，成為慢性HBV感染者。HBV母嬰阻斷失敗的影響因素包括妊娠女性相關因素（如HBeAg狀態、HBV DNA水平、HBV疫苗逃逸變異）、新生兒因素（如遺傳因素、免疫功能）以及其他相關因素（如免疫策略、疫苗接種是否及時、妊娠女性分娩方式、餵養方式）。妊娠女性HBV DNA水平與7月齡嬰兒乙肝疫苗免疫阻斷成功率相關。
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