(一) 臨床診斷病例
急性起病，發熱，手掌或腳掌部出現斑丘疹和皰疹，臀部或膝蓋也可出現皮疹。皮疹周圍有炎性紅暈，皰內液體較少;口腔粘膜出現散在的皰疹，疼痛明顯。部分患兒可伴有咳嗽、流涕、食慾不振、噁心、嘔吐和頭疼等症狀。
重症病例：
1、有手足口病的臨床表現的患者，同時伴有肌陣攣，或腦炎、急性遲緩性麻痺、心肺衰竭、肺水腫等。
2、手足口病流行地區的嬰幼兒雖無手足口病典型表現，但有發熱伴肌陣攣，或腦炎、急性遲緩性麻痺、心肺衰竭、肺水腫等
(二)實驗室診斷病例
臨床診斷病例符合下列條件之一，即為實驗室診斷病例
1、病毒分離
自咽拭子或咽喉洗液、糞便或肛拭子、腦脊液或皰疹液、以及腦、肺、脾、淋巴結等組織標本中分離到腸道病毒。
2、血清學檢驗
病人血清中特異性IgM抗體陽性，或急性期與恢復期血清IgG抗體有4倍以上的升高。
3、核酸檢驗
自病人血清、腦脊液、咽拭子或咽喉洗液、糞便或肛拭子、腦脊液或皰疹液以及腦、肺、脾、淋巴結等組織標本等標本中檢測到病原核酸。
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