雖然卵圓孔未閉沒有症狀，據相關調查顯示約有四分之一的人卵圓孔未閉情況。通常情況下認為可以不必治療。但是近年發現，卵圓孔未閉與不明原因腦栓塞、潛水減壓病、偏頭痛等疾病的關係密切，因此一些學者認為，對於具有不明原因腦栓塞病史者、潛水員、航天員及頑固性偏頭痛者合併卵圓孔未閉時應該進行修補治療。
據相關調查顯示，成年人中約有20％～25％卵圓孔不完全閉合，成為一功能性活瓣膜。由於左房壓高於右房壓，卵圓孔瓣處於關閉狀態，病人沒有臨床症狀，通常也不需要治療。當出現經常性咳嗽、便祕等情況下，右房壓會高於左房壓，左側薄弱的原發隔被推開，即出現右向左分流，靜脈系統的栓子就可能會通過未閉的卵圓孔到達腦動脈而引起腦梗塞，這樣的腦梗塞也叫矛盾栓塞。
國外大量研究表明，存在卵圓孔未閉者發生不明原因腦缺血事件的機率顯著高於無卵圓孔未閉者。因此，對於具有不明原因腦缺血發生病史，同時又有卵圓孔未閉、存在右向左分流的患者，應將卵圓孔封堵以絕後患。介入治療是一種不開刀的微創治療，通過血管將專用封堵器深入心臟房間隔處將未閉的卵圓孔封堵即可，技術成功率近100％。
我國專科醫生對腦梗塞的病因分析常考慮腦血管、大動脈等血管性因素以及心內膜炎、風溼性瓣膜病、左心房粘液瘤、左心房附壁血栓、心房纖顫等心源性因素，而對卵圓孔未閉、房間隔膨脹瘤等先天性心臟疾患因素還未給予足夠重視。
這類疾病在檢測方面有較高的技術要求，常規經胸彩超和單純經食道彩超檢出率不足10％。同時採用經食道超聲及聲學造影技術進行檢查，是目前最有效的辦法，檢出率接近100％。因此，對於常見高危腦中風因素、病因難明的尤其是年輕的腦缺血患者，應採用此項檢查確診是否患有卵圓孔未閉、房間隔膨脹瘤。
因為卵圓孔是左右心之間的一個通道，就可能使血液在左右心之間分流。通常左心壓力較右心高，左心的少量動脈血流入右心，即左向右分流，通常不引起症狀。在右心壓力增高(如咳嗽、憋氣、潛水)時，出現右心的靜脈血流入左心，即右向左分流。右向左分流通常也無症狀，但如右心繫統(靜脈系統)的一些物質隨血流進入左心就可產生症狀稱反向的血流或栓塞。
包括：
1、血栓栓塞：一些不明原因的腦栓塞就是由卵圓孔未閉引起，因靜脈系統血流較動脈緩慢，易形成血栓，如下肢的靜脈血栓可經過卵圓孔形成腦栓塞。卵圓孔附近的血流不規則，可形成血栓稱作房間隔瘤。房間隔瘤脫落後也可形成腦栓塞。
2、空氣：潛水員的減壓病就是由氣栓通過卵圓孔進入左心動脈系統引起的。
3、脂肪：手術後形成脂肪栓子，脂肪栓塞造成神經功能障礙。
4、低氧血癥：當有右心梗死，心包積液和嚴重的三尖瓣反流等情況時，由於右心的壓力增高導致更多的右到左的分流，由於低含氧量的血流進入左心，出現呼吸困難、頭昏眼花的症狀。
談到這裡有人要問：偏頭痛和卵圓孔未閉有什麼關係?
典型偏頭痛的特點：一側頭部的搏動性疼痛、伴有畏光畏聲、噁心嘔吐，常不能正常工作學習、持續1天或更長。少數偏頭痛病人伴有先兆(每次發作前的感覺訊號)：常見有閃光幻覺和其他視覺缺損。偏頭痛與遺傳、雌激素等有關。但具體的病因機制目前尚不明確。
最早發現偏頭痛和卵圓孔未閉的關係的人是日內瓦大學醫院的神經科醫生Roman Sztajzel，他在1999年收到一封患者來信，感謝他治好了自己30多年的偏頭痛。原來，這名患者曾二次發作腦栓塞，檢查發現了卵圓孔未閉，為了減少她再次發生腦栓塞。醫院為她動手術封堵了卵圓孔，而患者的偏頭痛也立即消失了。
從那時起，很多人開始關注於卵圓孔未閉和偏頭痛的關係。隨後不久，義大利學者就報道了頭痛患者中卵圓孔未閉發生率非常高;英國學者Wilmshurst報道了對減壓病患者封堵卵圓孔，竟使他們的偏頭痛也消失了。最近Anzola等研究發現，有先兆的偏頭痛病人患卵圓孔未閉的機會是正常人的2倍多，其安靜狀態下發生右向左分流的情況遠高於無偏頭痛的卵圓孔未閉。
卵圓孔未閉患者發生偏頭痛的具體機制尚不明瞭，有人認為可能和靜脈血中某種物質流入動脈系統到達腦部有關。所以如果患了偏頭痛，再進一步檢查是否患了卵圓孔未閉是非常必要的。
通常檢查卵圓孔未閉的方法常用有經胸超聲、經食道超聲、以及經顱多普勒微泡實驗檢查三種。經胸超聲簡單無創，但檢出率低，配合聲學造影，有經驗的超聲醫生才能使檢出率達到80％。而經食道超聲和經顱多普勒微泡實驗法的檢出率都相當高，均達95％以上，被稱作檢測卵圓孔未閉的金標準;有報道微泡法經顱多普勒超聲檢出率達99％。
經食道超聲為有創檢查，檢查過程要承受痛苦，檢查時患者不易配合檢查，都限制了其應用。而經顱多普勒微泡試驗法克服了以上缺點，為目前最流行的檢測卵圓孔未閉的方法。治療卵圓孔未閉的方法有手術縫補卵圓孔和經導管封堵兩種方法。因後者減少了開胸手術、體外迴圈的痛苦，並且成功率高，有逐漸取代前者的趨勢。
如果發現了自己患有卵圓孔未閉，並不是每一個患者都要治療。因為卵圓孔未閉發生率達人口的四分之一，多數都無症狀。如果發現了卵圓孔未閉，可諮詢醫生，只有一部分分流量較大，出現併發症狀的卵圓孔未閉才考慮手術治療。偏頭痛患者發生卵圓孔未閉是否要治療尚無統一標準，但一定要進行綜合考慮。卵圓孔封堵治療為治療偏頭痛提供了一個新的可能方法，使偏頭痛可能不在是一個終身疾
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