卵圓孔的形成是在胚胎髮育至第6、7周時，心房間隔先後發出2個隔，先出現的隔為原發隔或稱第一隔，後出現的隔為繼發隔或稱第二隔，原發隔自心房中線背側壁呈半月形長出，向房室管生長與心內膜墊融合，與房室隔尾端部留一小孔，稱為原發孔。在原發孔未閉合前，原發隔近頭端部分形成一孔，稱繼發孔，是胎兒時期的血液的正常通道。
同時在第一隔的右側由心房壁上又長出一鐮狀形隔，稱繼發隔或稱第二隔，此隔不繼續生長分離心房中途停止，鐮狀形凹陷呈卵圓形稱卵圓窩，卵圓窩處原發隔與繼發隔未能粘連融合留下一小裂隙稱之為卵圓孔，卵圓孔是胎兒發育必需的一個生命通道，來自母親的臍靜脈血也正是經此通道進入胎兒的左側心腔，然後分佈到全身，以此提供胎兒發育所需的氧氣和營養物質。
為什麼會有卵圓孔未必呢?新生兒出生時，隨著第一聲啼哭，左心房壓力升高，使左側的原發隔部分緊貼在右側的繼發隔上，發生功能性閉合，1年內達到解剖上的閉合。若年齡>3歲的幼兒卵圓孔仍不閉合稱為卵圓孔未閉，也可以理解為小型的房間隔缺損。卵圓孔未閉是目前成人中最為常見的先天性心臟異常，成年人中有20％～25％的卵圓孔不完全閉合，也就是在正常人群中約4人中即可檢出1人患有此病。
長期以來人們認為卵圓孔未閉一般不引起兩房間的分流，對心臟的血流動力學並無影響，因而認為“無關緊要”。那麼到底需不需要治療呢?部分國家對於卵圓孔未必的治療持積極的態度，但是在我由於經濟水平和生活壓力比較大，治療態度不夠積極。一般的患者小的時候，對身體影響缺損不大，都不會治療，但是長大後容易出現腦栓塞等問題。
近年來的許多研究表明，卵圓孔未閉與不明原因腦卒中患者之間存在著密切的聯絡，這是因為通過未閉的卵圓孔;
下列栓子可進入左心繫統引起相應的臨床症狀：
①下肢深靜脈或盆腔靜脈的血栓
②潛水病或減壓病所致的空氣栓子;
③手術或外傷後形成的脂肪栓子。而且對於發生過血栓事件的卵圓孔未閉患者其再發的危險性依然很高。
因此，針對病因治療，封閉高危人群的開放的卵圓孔，有望降低患者的發生率。另外，也發現卵圓孔未閉與減壓病、偏頭痛等的發病有關，所以閉合卵圓孔可能有益於上述患者。因此，在經濟條件允許的情況下，應該積極的治療。
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