氣道和食管之間的瘻管可為先天性或後天性，並可分為氣管-食管瘻和支氣管-食管瘻。雖然先天性異常通常在新生兒即可發現，但是前一型別可直到青少年甚至成年才被明確診斷。
氣道和食管之間的瘻管的病因不詳。遺傳、環境等因素與之有關。但至今尚無動物模型供研究，文獻中已有多次家庭病例報告。北京兒童醫院曾有兄弟二人相隔一年多分別患I和Ⅲ型食管閉鎖的。本疾病的雙胎率較平常流產兒中2.5%為高。北京兒童醫院曾統計169例中6例（3.5%）為雙胎之一。
以下也是導致氣道和食管之間的瘻管的病因：
1、食管其他惡性腫瘤
食管惡性腫瘤中最多見的是鱗狀上皮細胞癌即食管癌，約佔全部的95%以上，其他惡性腫瘤不足5%，臨床罕見的且種類繁多，一般包括上皮源性腫瘤、間質源性腫瘤、淋巴源性腫瘤和轉移瘤等4類。
2、瀰漫性食管壁內憩室
瀰漫性食管壁內憩室是非常少見的良性病變。Mendl等（1960）首次描述此病。本病特徵是食管壁多發的呈彌散性分佈的大小為1～3mm外突性小囊，該病變同時伴有食管炎症、纖維化及管壁增厚。
3、咽食管憩室
食管壁的黏膜層或全層從食管腔內向外突出，形成與食管腔相通的囊狀突起，稱為食管憩室。食管憩室多為後天性疾病，常見於成人。亦有先天性食管憩室形成者。
4、外傷性食管穿孔
食管穿孔（perforation of esophagus）是最嚴重的胃腸道急症之一，據報道其病死率為10%～46%。預後取決於致病原因、受傷部位，食管的基礎病變以及受傷後開始治療的時間。早期診斷與治療有賴於對該病的高度警惕以及對相應的臨床表現做出正確的判斷。
5、器械性食管損傷
器械性食管損傷指食管的醫源性損傷，器械性食管損傷穿孔在臨床中佔食管穿孔的很大部分。
注：此資訊源于網路收集，如有健康問題請及時咨詢專業醫生。