逆行性細菌感染是指細菌由尿道口往上進入泌尿系統，經由尿道到膀胱甚至進入腎臟或副睪丸、前列腺。大部份的細菌都來自腸道，尤以大腸桿菌最常見。
不良的衛生習慣和性行為，身體抵抗力下降。機體免疫功能下降時，不能充分發揮其吞噬殺滅細菌的作用，即使入侵的細菌量較少，致病力不強也能引起感染;條件致病菌所引起的醫源性感染也逐漸增多。細菌因素主要與病原菌的毒力和數量有關。毒力強或數量多的致病菌進入機體，引起敗血症的可能性較大。
尿路感染95%以上是由單一細菌引起的。其中90%的門診病人和50%左右的住院病人，其病原菌是大腸埃希桿菌，此菌血清分型可達140種，致尿感型大腸埃希桿菌與病人糞便中分離出來的大腸埃希桿菌屬同一種菌型，多見於無症狀菌尿或無併發症的尿感；變形桿菌、產氣桿菌、克雷白肺炎桿菌、銅綠假單胞菌、糞鏈球菌等見於再感染、留置導尿管、有併發症之尿路感染者；白色念珠菌、新型隱球菌感染多見於糖尿病及使用糖皮質激素和免疫抑制藥的病人及腎移植後；金黃色葡萄球菌多見於面板創傷及吸毒者引起的菌血症和敗血症；病毒、支原體感染雖屬少見，近年來有逐漸增多趨向。多種細菌感染見於留置導尿管、神經源性膀胱、結石、先天性畸形和陰道，腸道、尿道瘻等。
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