在小兒當中，內痔十分罕見，外痔在小兒偶爾有發生，表現為肛門邊緣上有面板覆蓋青紫色小結節狀物，有疼痛感，除非被粗硬的大便撐破，否則不出血。
比較常見的嬰幼兒肛腸病有如下幾種：
1、直腸息肉：小兒便血的最常見原因是直腸息肉，它也是小兒肛腸外科最常見疾病，可佔約30％。其形成原因可能與遺傳因素、炎症(如痢疾)、機械性慢性刺激(便祕、粗糙的糞便)、病毒等有關。息肉的形狀一般猶如一粒帶蒂的小葡萄，顏色由淡紅、深紅到紫色均有，表面可像桑葚或楊梅的刺狀，數目可單個或者多個，距離肛門口可近可遠，有時可因排便而被帶出到肛門外。這種息肉引起的便血一般顏色鮮紅，附著在大便表面而不互相混合，少見單純血便而無糞質者。細心觀察可在糞便上看到溝槽狀壓痕，為糞便通過息肉時所造成。小兒一般無腹痛、裡急後重等。長期少量出血可以引起小兒貧血，息肉還可能引起腸蠕動紊亂誘發腸套疊。
2、肛裂：多因糞便乾結引起，常發生在肛管後方正中，用雙手稍加分開一下肛門可以看到這一裂隙，肛裂時出血量少，色鮮紅，附在糞便表面或在手紙上可見；排便時劇烈疼痛，小兒因而哭鬧、不願排大便，又使患兒大便更加乾燥，致肛裂長久不愈。
3、肛門周圍膿腫：小兒，尤其是新生兒、嬰幼兒面板嬌嫩，容易因大小便浸漬、粗硬不潔尿布的摩擦、粗糙手紙的損傷等，致化膿性細菌侵入引起。全身也可發熱，小兒可有哭鬧、拒食、嘔吐現象。如未治療可化膿潰破流膿形成肛瘻。
4、肛門瘙癢：小兒肛門瘙癢的一個常見疾病是蟯蟲病。蟯蟲寄生在腸道，雌蟲往往在夜間爬出肛門外排卵，蟲卵汙染手指、衣被，然後直接或經過揚起的灰塵進入消化道，再發育成成蟲，因此發生自身的重複感染或感染他人。肛門瘙癢往往發生在夜間，影響睡眠。家長可在小兒入睡2-3小時後，檢查肛門周圍面板皺褶處，可發現白色線頭樣的成蟲。
5、脫肛：嬰幼兒的直腸與肛管上下處在一條直線上，與周圍組織比較鬆弛，肌肉比較薄弱(尤其是營養不良或有消化性疾病患兒)，在2歲前後開始坐便盆排便，此時會陰底部所受腹壓要大，如有便祕需要使勁摒氣，延長坐盆時間，或頻繁腹瀉，或有咳嗽、包莖、尿道膀胱結石等增加腹壓的情況，均容易引起脫肛。脫肛初始僅在用勁排便時出現，便後可以自動縮回，後來可能要用手幫助送回去，不大便時(如哭鬧)也可出現。如長時間不將它送回，可發生水腫、滲血、潰瘍而引起墜脹、疼痛、裡急後重、流膿血粘液。絕大多數脫肛的患兒可在5歲之前自愈。
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