（1）不育症
正如我們所知道的，正常情況下，陰囊溫度低於體溫2℃～3℃左右，這種溫度差異乃是確保精子發生的重要條件之一。而雙側隱睪病人由於睪丸不在陰囊內，其與體溫的溫度差異也隨之消失，而溫度的升高可使睪丸上皮萎縮，從而阻礙精子發生，產生不育。單側隱睪從嬰兒出生後第二年起，對對側正常位置的睪丸也有損害，故不及時治療，也可能影響生育。
（2）疝
多是由於睪丸下降不全而使腹膜鞘突不能閉合， 致使腹腔內容物循路下降所致。疝作為隱睪的合併症，國內報道在50％左右，國外報道高達66％～97％。
（3）精索扭轉
可能是提睪肌收縮過強，睪丸引帶發育不良， 睪丸移動度過大引起。據統計，有精索扭轉的病人中約50％患隱睪症。
（4）睪丸創傷
位於腹股溝處的睪丸，因其位置表淺，且腹股溝後壁比陰囊堅硬而且無彈性，缺乏緩衝性，故易受創傷。
（5）惡性變
隱睪發生惡變的機會多於正常位置的睪丸，大約是30～50 倍。另外，單側隱睪病人的另一側睪丸腫瘤的發生率也高於正常人。
（6）精神創傷
陰囊內無睪丸可引起患者精神上的創傷，並有自卑感。
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