肝癌易出現癌熱，常為間歇熱，無畏寒或寒戰，持續時間很長。偶見持續高熱而無明顯毒血癥症狀。此種癌熱對消炎痛、萘普生等退熱藥及皮質激素退熱敏感，但停藥後發熱又起，易誤診為結核、傷寒類感染及結締組織病等，從而延誤正確診斷。癌熱發生的原理，可能由於癌組織本身或浸潤的白細胞所產生的致熱原或腫瘤壞死因子所致。但反過來說，診斷也必須排除感染。
原發性肝癌常發生在肝硬化基礎上。據統計，至少80%的肝癌伴有肝硬化，而因肝硬化最終導致肝癌者約佔15%～75%。故對肝硬化患者，特別是其中的乙肝、丙肝病毒感染者，應高度警惕肝癌的發生，要定期作相關檢查。此外，醫院在收治肝硬化併發上消化道出血患者時，醫生的工作常主要放在止血措施和防肝昏迷等方面，而忽視患者可能已存在的肝癌（特別是瀰漫型肝癌），導致誤診或漏診。
約10％的肝癌患者因癌塊破裂出血而死亡，可因外力或自發破裂。如侷限於肝包膜下，則出現劇烈右上腹痛。如破入腹腔則出現急腹症表現。此外，中晚期肝癌易發生自發性腹膜炎，也極易誤診。
一些肝癌病人的消化道症狀以腹瀉為主，易誤診為慢性腸炎或吸收不良綜合徵。出現腹瀉亦可為肝癌的首發症狀，有人統計3254例肝癌病人中，以腹瀉為首發症狀者佔5.8%。
肝癌患者最常見的伴癌綜合徵，發生率佔10%～30%（上海肝癌研究所統計為17.4%），在肝癌未查出時易誤診。其發生原因可能主要與肝癌細胞可異位產生胰島素有關。此症嚴重者可致昏迷、休克導致死亡。
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