目前慢乙肝抗病毒藥有兩類：需要注射的長效干擾素和口服的核苷類藥物。前者實現e抗原血清學轉換和表面抗原清除的機會較大，如治療有效48周後可長期停藥，不過干擾素需要注射治療，很多病友對治療期間的區域性或全身不良反應有很大顧慮。核苷類藥物與干擾素不同，這類藥物僅需要口服，比較方便，而且總體而言不良反應較少，因此更容易被病友接受。
不過，核苷類藥物治療也有它的侷限：需要長期治療，而且，隨著核苷類使用時間的延長，各種各樣的問題也會出現，病友們應該有所瞭解，不能覺得只要每天服藥就高枕無憂。
長期核苷類藥物治療面臨的問題有2個主要方面，一是耐藥，二是不良反應。核苷類的作用機制是直接抑制乙肝病毒複製，具體的機制比較複雜，簡而言之，乙肝病毒是一條很長的脫氧核苷酸鏈，它會在聚合酶的幫助下不斷複製，核苷類藥物可以阻斷這個酶的作用，從而抑制病毒複製。剛開始服藥後，這種作用可以很好的發揮，但在藥物的壓力下，乙肝病毒會逐漸發生變異，逃避藥物對聚合酶的影響，也就是發生耐藥變異。
顯然，由於這種機制，耐藥難以避免，不過不同的核苷類藥物耐藥發生率存在差異，其中目前應用最大的拉米夫定的耐藥的可能性比最高。一旦發生耐藥變異，原本有效的核苷治療失效，轉氨酶和病毒水平都會重新升高，有可能造成疾病的加速進展。為了避免耐藥變異後疾病進展，服口服藥以後要堅持隨訪，及早發現問題，採用聯合治療或者換藥的方案，而且在變更治療方案時，應注意避免交叉耐藥、多要耐藥等更復雜的問題出現。
對於核苷類長期治療的安全性問題，也切不可大意。雖然口服核苷類藥物總體而言安全性良好，但隨著治療時間的延長安全性也會成為問題。核苷類主要從腎臟排洩，因此，在核苷治療後應監測血清肌酐水平、腎功能等指標。有研究顯示，阿德福韋連續使用4-5年，3％會出現腎毒性。另外，阿德福韋和替諾福韋還有可能引起患者骨密度下降，替比夫定會引起橫紋肌疾病。
總之，核苷類藥物需要長期治療，選擇這一治療方案後，要有耐心，一方面堅持用藥，另外一方面要做好定期複查，及早發現問題，儘早處理，保障療效。
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