結腸鏡檢查是指將纖細柔軟帶有鏡頭的內窺鏡軟管從肛門伸入到患者的腸腔裡，藉助鏡頭能清晰地觀察到直腸、乙狀結腸、降結腸、橫結腸、升結腸、盲腸等整個大腸腔的具體病變，發現病變時能取下可疑的腸道組織並做病理檢查。因此，結腸鏡檢查被稱為結直腸癌診斷的金標準。
結腸鏡檢查過程中，為了使內窺鏡順利地進入腸腔，醫務人員會不定時地向患者腸道充氣；與此同時，能獲得更理想、清晰的腸道檢視便於更好地觀察腸腔情況；初始充氣過程中，患者會感覺有腹脹感，但聽從醫務人員的指導，腹脹感會逐漸適應。另外由於人的腸道是“九曲十八彎”的，鏡身到達拐角彎處時，疼痛感會伴隨腹脹感出現（每個人的腸道情況不一，因此出現的疼痛感也是因人而異的，並不是說所有的人都存在類似感受）。
結腸鏡檢查針對的部位是人體的大腸，檢查過程中產生的腹脹感、疼痛感一般人是可以耐受，除個別耐受能力差的患者外，一般患者可選擇普通腸鏡進行檢查。而小腸的檢查通常是由小腸鏡來擔當，小腸鏡可以從口腔或者肛門進入，檢查手段與結腸鏡檢查類似；但由於小腸的長度佔全腸道的五分之四，故在進行小腸鏡檢查時需在腹腔內盤旋幾圈，帶來的疼痛感一般人難以耐受，因此檢查小腸可選擇無痛小腸鏡或膠囊內鏡進行。
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