宮頸癌疫苗到目前為止，最常見的副作用就是在注射後區域性會有紅腫疼痛表現，嚴重的可能會出現接種後發燒嘔吐的情況，甚至還可能出現頭目眩暈，肌肉無力症狀。
而宮頸癌疫苗的型別分為二價疫苗、四價疫苗和九價疫苗，三種疫苗只是由於針對的HPV型別不同，所以適合的年齡階段也會有所差異。但無論是哪型別的宮頸癌疫苗，一般在接種後出現的副作用，其實特別少見，只是在接種後，可能在接種區域性會出現紅腫疼痛，這其實跟普通疫苗接種後的副作用基本一樣，只有在國外才出現接種後有發熱、嘔吐、頭目眩暈，肌肉無力等症狀，但是這種情況目前只有幾例，。在中國還沒有出現，所以宮頸癌疫苗的副作用其實特別小，因此對於需要接種宮頸癌疫苗的女性，通常都可以考慮進行接種，不用擔心宮頸癌的疫苗副作用會引起嚴重的不良現象。
只是對於有性生活的女性，接種宮頸癌疫苗前，不是必須先要做HPV檢查確診，已經有HPV感染時也可以進行接種。
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