直腸息肉的處理原則是發現息肉即行摘除。目前摘除息肉的方法主要是內鏡下行各種摘除法。根據息肉的形態、大小、數量及蒂的有無、長短粗細而分別採用：
1、高頻電凝圈套切除法：主要用於有蒂息肉；
2、高頻電凝灼除法：主要用於多發半球狀小息肉；
3、高頻電凝熱活檢鉗法：目前很少應用，主要被②④法取代；
4、活檢鉗除法：主要用於單發或少數球狀小息肉，簡便易行，又可取活組織病理檢查；
5、鐳射氣化法和微波透熱法；適於無需留組織學標本者；
6、粘膜剝離嵌除法：主要用於扁平息肉或早期癌患者；
7、“密接”摘除法，主要用於長蒂大息肉，難以懸於腸腔者採用大息肉密接腸壁電凝切除法。
8、分期批摘除法，主要用於10～20顆以上息肉患者無法一次切除者。
9、內鏡、外科手術聯合治療法，主要用於息肉病患者，即將息肉稀疏區以手術切除，這樣即可達到治療目的，又可維持大腸正常功能。
由於直腸息肉，特別是腺瘤性息肉已被學者公認為癌前期病變。所以，直腸息肉患者的定期隨訪已被提到防治早期直腸癌的高度來認識。
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