慢性咳嗽的診治首先需要在認真詢問病史、細緻體格檢查和選擇適當輔助檢查的基礎上，建立慢性咳嗽病因的初步診斷，然後經相應針對性治療來證實或排除診斷，最終確定病因並解除咳嗽症狀。
第1種流程：先全面檢查，後針對性治療
該診治流程根據引起慢性咳嗽的各種病因進行全面的輔助檢查，如鼻旁竇X線片、肺通氣功能、支氣管舒張或激發試驗、誘導痰細胞分析、撥出氣一氧化氮檢測、食管阻抗-pH監測、纖維支氣管鏡和胸部CT等，依據檢查結果結合病史建立可能的病因診斷，再進行相應的病因治療，如咳嗽緩解或消失就證實診斷，治療失敗則排除診斷。
“先全面檢查，後針對性治療”流程的優點是能迅速明確病因，取得療效的診治時間較短，但費用較昂貴，且假陽性檢查結果會對病因診斷造成干擾，導致過多虛假病因診斷。
第2種流程：邊檢查，邊治療
“邊檢查，邊治療”即綜合分析患者的病史、症狀和體徵，考慮咳嗽病因的可能性，優先對可能性最大的某一病因進行輔助檢查，建立臨床診斷，通過觀察患者的治療反應明確或排除該病因。然後再對慢性咳嗽的其他病因進行檢查治療，直至所有病因明確並控制咳嗽，見圖2。該流程每步選擇的輔助檢查目標性強，醫療總花費相對較少，但如果初始診斷不正確，需進行隨後所有的診療步驟，可能要更長時間才能控制咳嗽。
在臨床實踐中，臨床醫生需要綜合考慮患者的經濟條件、就醫意願和醫院的技術裝置條件選擇上述診治流程。
連結：經驗性治療時應注意的事項
根據醫院條件和患者經濟狀況選擇恰當的治療策略和方案，力求經濟有效。
藥物劑量要足夠，避免因劑量不足導致療效差，從而對病情產生誤判。
治療時間前移。在排除感染後咳嗽後，可從亞急性咳嗽開始治療，不必拘泥於慢性咳嗽病程定義。
密切隨訪，根據治療反應隨時調整治療措施。口服糖皮質激素時，注意其不良反應，特別是可能的潛在感染惡化和擴散。經驗性治療並非對症治療，應儘量避免單純應用鎮咳藥物。多數慢性咳嗽病因與感染無關，一般沒必要使用抗生素。
經驗性治療要有時間限制。對UACS、CVA和EB，一般先治療1周，GERC一般先治療2～4周，有效則切換到相應病因的標準療法，無效則針對其他常見病因治療。仍無效時，要及時轉診到有條件的醫院以查明病因，以免耽誤早期肺癌或其他肺部疾病的診治。
注：此資訊源于網路收集，如有健康問題請及時咨詢專業醫生。