甲亢的治療主要有三種方法：抗甲狀腺藥物、同位素碘131治療和手術治療。
這三種治療方法各有其優缺點，應該根據甲亢的病因、病人的年齡、甲狀腺的大小、甲亢復發史、有無妊娠、有無突眼、有無甲亢性心臟病、病人對治療的態度、病人醫療條件等因素綜合分析，加以選用。
藥物治療甲亢具有應用普遍、有效、靈活、便宜等優點，但是藥物治療療程長，易復發，少數會引起粒細胞缺乏症和肝功能損傷的副作用。
相比之下同位素治療甲亢雖然一次性費用較高，但總的費用並不高，且不需要長期的隨診，具有簡單，方便。有效的特點。但有出現甲低的可能
對於甲狀腺腫大十分明顯或懷疑甲狀腺腫瘤的甲亢患者應積極採取手術治療。
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