黃褐斑的病因尚無定論，存在有多種影響因素，多數沒有確定。目前經過調查，公認的幾個治病因素：
1、內分泌失調
體內激素的變化可能和黃褐斑有關，比如孕婦就容易出現面部色斑，這種懷孕期間產生的色斑有些會在產後長期存留下來形成頑固的黃褐斑。
有報告顯示女性黃褐斑患者的黃體生成素水平增高、雌激素減低，而男性黃褐斑病人的黃體生成素水平增高、睪丸激素減低。很多黃褐斑的色澤深淺會隨著女性生理週期而產生變化。也有報告顯示口服避孕藥會引發黃褐斑。
2、紫外線
紫外線對黃褐斑的形成有重要的作用，其中紫外線B對黃褐斑的形成更加重要,它可以通過刺激酪氨酸酶的活性而增加黑色素的合成。幾乎所有的治療方法中都非常強調在治療的同時要避免日晒。塗抹防晒霜能夠有效防止黃褐斑的產生。
3、微生物失衡
黃褐斑的形成可能和面板表面的微生態失衡有關，黃褐斑區域的痤瘡丙酸桿菌、微球菌和革蘭氏陰性桿菌較正常人顯著增多，這些細菌能夠產生褐色素和菊黃色素。常住厭氧菌的活菌數與分離率減少，使面板定植抗力降低，菌群之間的競爭性抑制和干擾力減弱，導致其他產色素的微球菌大量繁殖，從而出現面板的色素沉著。
4、自由基損害
自由基可以損害人體的各種組織，黃褐斑的形成也可能與自由基有關。體內的氧自由基過量產生，以及抗氧化酶活性降低，可能引發黃褐斑。甚至有人認為血管內皮細胞的一氧化氮改變可能也和黃褐斑有關。
5、面板屏障作用破壞
不當的化妝和洗臉習慣，長期過度的刺激面板，使得面板的屏障作用減弱，從而產生黃褐斑。
6、遺傳性
有人認為黃褐斑有遺傳傾向，大約30％的黃褐斑患者有家族史[。 雖然相關因素很多，但依然難以確認真正的病因，多數患者沒有一個明確的病因，排在前2位的相關因素是日晒（51.6％）和面板過度揉搓（50.1％），前者是普遍為大家所認同的一個黃褐斑形成原因，而後者可能會造成面板組織結構的破壞，從而造成一系列的因果效應，最終導致黃褐斑的產生。
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