整個妊娠期長達10個月，在此漫長的時間內，孕婦可能會遇到一些疾病需要藥物治療。在妊娠期，胚胎或胎兒處於發育的不同階段，各器官功能尚不完善，如用藥不當對胚胎或胎兒可能發生不良影響。我國在妊娠期用藥上目前存在的問題有兩方面：一方面，孕婦患有各種疾病需要用藥物治療時拒絕用藥，以致於病情加重，延誤治療；另一方面，孕婦患病需要用藥物治療，藥物選擇不合理。因此，如何在妊娠期選擇安全、有效的藥物，適時適量用藥，對提高胎兒質量非常重要。
一、藥物對胚胎及胎兒的影響：
在妊娠期使用藥物是否會引起胎兒畸形，應考慮藥物本身的性質、使用劑量、用藥時胎齡以及藥物可能存在的個體差異，而最重要的是用藥時的胎齡。
1、藥物本身的性質：
脂溶性越高、分子量越小的藥物越容易透過胎盤，如止痛劑、鎮靜劑、安眠藥等。
2、用藥的劑量：
藥物使用劑量和其對胎兒的影響有很大關係，小劑量藥物有時只造成暫時性損害，而大劑量藥物則可使胎兒發育嚴重受影響，甚至引起胚胎或胎兒死亡，用藥時間越長，對胎兒的影響就越大。
3、人體的個體差異：
藥物對胎兒的損害與胎兒的遺傳素質有關，同樣的藥物，動物與動物、動物與人之間有不同的影響，不同的人因為遺傳素質不同，對藥物反應也不盡相同。
4、用藥時胎齡：
用藥時胎齡與藥物對胎兒的影響關係密切，受精後2周內（末次月經後四周內），藥物對胚胎的影響是“全”或“無”的，“全”表現為引起胚胎死亡，導致流產；“無”則為胚胎繼續發育，不出現異常。受精後3-8周（即末次月經後5-10周），為器官分化發育階段，此時期用藥對胚胎影響最大，稱“致畸高度敏感期”，容易產生形態上的異常而形成各種胎兒畸形。受精後第9周（末次月經第11周）至足月是胎兒生長、器官發育、器官功能完善階段，而神經系統、生殖系統和牙齒仍在繼續分化，特別是神經系統分化、發育和增生是在妊娠晚期和新生兒期達高峰。在此期間受到藥物的影響後，主要引起神經系統、生殖系統和牙齒的發育不正常。對神經系統的損害往往表現為行為異常，如出生後小兒多動症等。
二、在妊娠期及哺乳期如何正確用藥：
有受孕可能的婦女用藥時，需注意月經是否過期，如果月經已過期，在用藥前應先檢查是否已受孕。孕婦在其它科就診時，應告訴醫生自己已懷孕和妊娠時間，而作為醫生，無論是婦產科醫生還是其它科醫生，在診治疾病時均要詢問末次月經及受孕情況，以免對胚胎或胎兒造成影響。孕婦健康狀況對胎兒的生長髮育非常重要，若患有急、慢性疾病，在受孕前要進行治療，待治癒後或在醫生指導監護下妊娠。孕婦患病應及時就診，正確用藥，不能因為擔心藥物對胎兒的影響而延誤治療，儘量使用對胎兒無影響或者影響較小的藥物。孕期可用可不用的藥物儘量不用，尤其是在妊娠的前3個月。煙、酒、麻醉藥均屬藥物範疇，對孕婦和胎兒同樣有害。一般而言，能用一種藥物就儘量避免多種藥物聯合使用，能用結論比較肯定的藥物就避免使用比較新的、但尚未肯定是否對胎兒有不良影響的藥物。嚴格掌握用藥劑量、用藥持續時間，注意及時停藥。
如果孕婦已用了某種對胎兒有嚴重影響的藥物，應根據用藥劑量和用藥時孕周等因素綜合考慮，早孕期間若用了明顯致畸作用的藥物，應考慮終止妊娠。哺乳期用藥一般不需要中斷哺乳，可選擇在哺乳後立即服藥，儘可能延遲下一次哺乳時間，延長服藥與哺乳時間的間隔，以減輕乳汁中的藥物濃度。但是，如果母親使用可能對嬰兒有潛在影響的藥物時，就應該考慮停止哺乳。
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