1、繼發性三叉神經痛：多發性硬化、延髓空洞症、顱底腫瘤等；
2、牙痛：三叉神經痛常誤診為牙痛，往往將健康牙齒拔出，甚至拔出全部牙齒仍無效，故應注意。牙病引起的疼痛為持續性鈍痛，侷限於牙齦部，可因進食冷熱食物加劇；
3、副鼻竇炎：如額竇炎上頜竇炎等，為侷限性持續性痛，可有發熱、鼻塞、膿涕及區域性壓痛等。
4、青光眼：單側青光眼急性發作易與三叉神經第1支痛相混，青光眼為持續性痛，不放射，可有嘔吐，伴有球結合膜充血前房變淺及眼壓增高等。
5、顳M關節炎：疼痛侷限於顳M關節區，呈持續性，關節部位有壓痛，關節運動障礙，疼痛與下頜動作關係密切，可行X線及專科檢查協助診斷。
6、偏頭痛：疼痛部位超出三叉神經範圍，發作前多有視覺先兆，如視力模糊、黑點等，可伴嘔吐。疼痛為持續性，時間長，往往半日至1-2日。
7、三叉神經炎：病史短，疼痛呈持續性，三叉神經分佈區感覺過敏或減退，可伴有運動障礙，在受累的三叉神經分支有明顯壓痛。神經炎多在感冒或副鼻竇炎後發病。
8、舌咽神經痛：易與三叉神經第3支痛相混。常見於年輕婦女，侷限於扁桃體、舌根、咽及耳道深部，即舌咽神經分佈區的陣發性疼痛，性質類似於三叉神經痛，吞嚥、講話、哈欠、咳嗽常可誘發。
9、蝶顎神經痛：發作時鼻粘膜充血、阻塞、流淚，特點為疼痛限於顏面之下半部。疼痛由牙出發，陣發性，持續幾分鐘至幾小時，可再發或持續性。
10、面部神經痛：多見於青年人，疼痛超出三叉神經範圍，可延及耳後、頭頂、枕頸，甚至肩部等。疼痛持續性，可達數小時，與動作無關，不怕觸控，可為雙側性疼痛，夜間可較重。
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