慢性萎縮性胃炎臨床表現僅為上腹飽脹、噯氣、胃納減退等消化不良症狀，有時因胃內因子分泌減少，維生素B12吸收不良可致貧血。內鏡檢查及活檢是確診慢性萎縮性胃炎的唯一手段。
慢性萎縮性胃炎治療方法很多，具體那種治療方式最有效，要結合具體的個體採用不同的方式。
1、一般治療：
慢性萎縮性胃炎患者，不論其病因如何，均應戒菸忌酒，避免使用損害胃粘膜的藥物如阿斯匹林、消炎痛、紅黴素等，飲食宜規律，避免過熱、過咸和辛辣食物，積極治療慢性口、鼻、咽部感染病灶。
2、補充消化酶製劑：
可選用消化酶製劑如複方阿嗪米特或胰酶片治療，以改善消化不良症狀。
3、抗幽門螺旋菌治療：
慢性萎縮性胃炎時，胃酸降低或缺乏，胃內細菌孽生，尤其是幽門螺旋桿菌檢出陽性率很高。應用抗生素類藥物，對促進慢性萎縮性胃炎的症狀改善有一定療效。根除幽門螺桿菌，有助於減輕和消除臨床症狀，以及對同時合併存在的活動性胃炎也有一定效果。
4、抑制膽汁反流和改善胃動力：
消膽胺可絡合反流至胃內的膽鹽，防止膽汁酸破壞胃粘膜屏障，方法為每次3～4g,1天3～4次。硫糖鋁可與膽汁酸及溶血卵磷脂結合，也可用於治療膽汁反流，方法為05～1g,1天3次。亦可給予熊去氧膽酸(UDCA)，每次100mg，每日3次。研究發現膽汁中對胃粘膜最有毒害作用的是去氧膽酸和石膽酸在膽汁反流患者胃液中膽汁酸以膽酸和去氧膽酸為主，UDCA僅佔1％。服用UDCA，胃液內膽汁酸以UDCA為主(可佔43±15％)，而膽酸，去氧膽酸和石膽酸濃度明顯下降，從而減輕後兩者對胃粘膜的損害作用。胃復安、嗎叮啉、莫沙必利等藥可增強胃蠕動，促進胃排空，協助胃、十二指腸運動，防止膽汁返流，調節和恢復胃腸運動。
5、加強胃黏膜營養治療：
胃黏膜保護劑增加胃粘膜更新，提高細胞再生能力，增強胃粘膜對胃酸的抵抗能力，達到保護胃粘膜作用，可以選用硫糖鋁、麥滋林S、尿素囊、生胃酮、前列腺素E等。
6、五肽胃泌素和激素：
五肽胃泌素除促進壁細胞分泌鹽酸，增加胃蛋白酶原分泌外，還對胃粘膜以及其他上消化道粘膜有明顯的增殖作用，可用於治療低酸無酸或有胃體萎縮的慢性萎縮性胃炎患者。
7、糖皮質激素：
部分慢性萎縮性胃炎發病與自身免疫有關，故可以試用短程強的鬆等作免疫抑制治療。本法應尤適用於PCA陽性並惡性貧血的慢性萎縮性胃炎患者，但臨床效果亦不太確切。
8、對症治療：
包括解痙止痛、止吐、助消化、抗焦慮、改善貧血等。對於貧血，若為缺鐵，應補充鐵劑。可以補充葉酸、VitB12。
9、手術治療：
中年以上的慢性萎縮性胃炎患者，如在治療或隨訪過程中出現潰瘍、息肉、出血，或即使未見明顯病灶，但胃鏡活檢病理中出現中、重度不典型增生者，結合患者臨床情況可以考慮內鏡下粘膜切除術，或部分胃切除。需要根據具體情況以及病人需求斟酌。另外從這類患者胃切除標本中有可能檢出早期胃癌。
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