反覆或持續HP感染、不良飲食習慣等均為加重胃黏膜萎縮和腸化的潛在因素。水土中含過多硝酸鹽和亞硝酸鹽、微量元素比例失調、吸菸、長期飲酒，缺乏新鮮蔬菜與水果及所含的必要營養素，經常食用黴變、醃製、燻烤和油炸食品等快餐食物，過多攝入食鹽，有胃癌家族史，均可增加慢性萎縮性胃炎患病風險或加重慢性萎縮性胃炎甚至增加癌變可能。
慢性萎縮性胃炎常合併腸化，少數出現上皮內瘤變，經歷長期的演變，少數病例可發展成胃癌。低級別上皮內瘤變大部分可逆轉而較少惡變為胃癌。
慢性萎縮性胃炎尤其是伴有中重度腸化或上皮內瘤變者， 要定期進行內鏡和病理組織學檢查隨訪。一般認為，中、重度慢性萎縮性胃炎有一定的癌變率。為了既減少胃癌的發生，又方便患者且符合醫藥經濟學要求，活檢有中、重度萎縮並伴有腸化的慢性萎縮性胃炎1年左右隨訪1次，不伴有腸化或上皮內瘤變的慢性萎縮性胃炎可酌情內鏡和病理隨訪。伴有低級別上皮內瘤變並證明此標本並非來自於癌旁者，根據內鏡和臨床情況縮短至6個月左右隨訪1次，而高級別上皮內瘤變必須立即確認，證實後採取內鏡下治療或手術治療。
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