在各種先天性食管畸形中 食管閉鎖最常見，先天性食管閉鎖病例中約4 ％並有先天性心臟血管畸形，另 6％並有其它畸形。按食管閉鎖的部位以及是否並有食管氣管瘻，
先天性食管閉鎖可分為五種型別：
1、食管近段為盲端，遠段通入氣管後壁，形成食管氣管瘻此型最常見，約佔85 ％。
2、食管近段通入氣管後壁，形成食管氣管瘻，遠端為盲端，此型少見，約佔 4％。
3、食管近段及遠段均為盲端 ，通入氣管，無食管氣管瘻，此型佔2 ％。
4、食管近段及遠段均分別通入氣管後壁，形成兩處氣管食管瘻此型亦很少見 佔1 ％。
5、食管腔通暢，無閉鎖，但食管前壁與氣管後壁相通形成食管氣管瘻，佔 4％。
先天性食管閉鎖的症狀食管閉鎖的典型有用臨床表現為唾液不能也不下嚥，返流入口腔 出生後即流涎 吐白沫，呼吸道空氣可經瘻道進入胃腸道，引起腹脹，同時胃液亦可經食管氣管瘻返流入呼吸道，引致吸入性肺炎，呈現發熱氣急，如不及時治療遇到數日內即可死於肺炎和嚴重失水。
先天性食管閉鎖的治療
先天性食管閉鎖病例未經治療，出生後數日即死亡。因此明確診斷後應儘早施行手術糾治畸形。術前應注意適量補液，糾正脫水和電解質失衡;防治吸入性肺炎加重;給予抗生素藥物;保持正常體溫，於上段食管腔內放入細導管，持續負壓吸引，或吸除口腔分泌物，以預防或減少口腔分泌物被吸入肺內，肺部炎症或肺不張病例需維持通氣功能和給予氧吸入。
手術操作：通常採用右胸側後切口經第4肋間切口進胸， 在胸膜外或切開胸膜，在胸腔內切斷結紮奇靜脈，遊離下段食管，繞置以細帶便於牽拉時在氣管後壁顯露食管氣管瘻，在距氣管後壁約5mm處切斷瘻管，用縫線間斷橫向縫合氣管修補瘻口，再用鄰近胸膜覆蓋。
吻合口前壁全部縫合之前將術前經鼻或口腔預置的細導管通過吻合口置放入胃內，用作術後減壓和餵食，亦可另作胃造瘻術。在胸膜外或胸膜腔內放置引流管， 待術後2-3周左右,經食管X線檢查證實吻合口已癒合後再拔除引流管，此後即可經口進食，術後 3-4周可開始食管吻合口擴張術 使吻合口內徑達到0.5cm 以上。
體重不及1500kg的早產兒、一般情況欠佳或並有其他器官嚴重先天性畸形的病例，需分期施行矯治術。第一期手術時切斷，縫合食管氣管瘻，另經腹部切口作胃造瘻術，於上段食管內放入導管作持續負壓吸引或作頸段食管造瘻術，以防止發生吸入性肺炎，數週後待體重增加到5kg左右，再施行第二期手術吻合上 下段食管。
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