很多慢乙肝患者剛被診斷後不免茫然失措，擔心疾病對健康的影響，希望能有辦法徹底擺脫疾病。但總有部分患者急於求成，聽信偏方、驗方，忽視慢乙肝治療最關鍵的組成：抗病毒治療。
對慢乙肝而言，抗病毒藥物是目前唯一被科學證實可以改善病情，延緩疾病進展的有效治療方案，是慢乙肝真正的治療核心。而慢乙肝的初始治療選擇非常重要，可以說這個選擇會對患者未來的生活帶來長期的影響。
慢乙肝患者在診斷時大部分是“大三陽”患者，對於肝臟炎症活動狀態的“大三陽”患者，也就是ALT高於正常水平(一般超過2倍以上ALT上限)，HBV DNA水平超過100000拷貝/毫升的患者應該考慮開始抗病毒治療。
目前抗病毒藥物有2類：長效干擾素類和核苷(酸)類似物。兩類藥物的作用機制不同，療效也存在一定差異。長效干擾素的最大特點是e抗原轉換率較高，可以通過有限療程實現持久的免疫控制，但這類藥物相對費用較高，需要注射使用。核苷(酸)類似物可以比較快的抑制病毒，費用較低，口服方便，不過這類藥物最大的問題是需要長期治療，耐藥風險較高，易復發，在長期使用中也存在安全性的風險。
兩類藥物的優缺點很清楚，但是具體該怎麼選擇呢?最新的慢乙肝指南，例如2013年的NICE(英國)指南與2015年的APASL(亞太)指南都建議，慢乙肝患者應考慮一線選擇長效干擾素治療。NICE(英國)指南給出的具體建議是，慢乙肝患者應該先考慮長效干擾素治療，如果長效干擾素治療應答不佳再進行核苷(酸)類似物治療。
這一推薦，主要是考慮患者如果先嚐試長效干擾素治療有可能通過有限療程(通常為48周)實現停藥後持久應答，即使治療應答不佳也不妨礙繼續接受核苷(酸)類似物治療，但這樣的治療順序增加了患者持久免疫控制的機會。
簡單而言，對病友來說，如果一開始選核苷(酸)類似物可能要面對的是一輩子服藥;但如果選擇長效干擾素治療，則有希望在未來擺脫長期服藥的困擾。
當然，慢乙肝是個複雜的疾病，並不是每位病友對長效干擾素治療都能有好的應答。據研究，有三分之一的患者在接受長效干擾素治療後能實現持久的免疫控制。
而對於一些優勢患者，也就是ALT水平較高，HBV DNA水平較低的人，這一比例就超過60％，對於這類患者長效干擾素顯然是更好的選擇，可以考慮把握機會，爭取擺脫疾病困擾。而對於選擇了核苷(酸)類似物治療的病友，則一定要堅持治療，切不可隨意停藥，以免疾病進展，危害健康。
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