牙齦切除術後有血塊覆蓋創面，數小時內有大量中性多形核粒細胞移出覆蓋創面，創面根方的口腔上皮細胞在9～13小時後開始由創緣向牙面爬行，1～2天時上皮的分裂活動達到高峰，2～5天時上皮以每天向牙面0．5mm的速度生長，約5～14天時薄層上皮完全覆蓋創面，但上皮的角化和完全修復約需4周。血塊下方的新結締組織在術後24小時即開始生成，主要為含新生毛細血管的肉芽組織，第3～4天時增殖達高峰並向冠方生長，約5～7天時形成新的遊離齦，此後上皮開始向齦溝內生長，約在術後4～5周時形成新的結合上皮，以半橋粒體和基底板的方式與牙面牢固地結合。
約在牙齦切除術後2周時臨床上牙齦外觀正常，正常的齦溝建立，但組織學上的完全癒合則需6～7周，齦溝液的量在術後一週內增加，在約5周時恢復正常。如果手術時將原有的結合上皮完全切除，則癒合後附著水平略有喪失，牙槽嵴頂也有輕微的吸收。牙齦切除術後的癒合過程雖然一樣，但癒合時間的長短受手術創面大小、區域性刺激因素及感染等因素的影響。
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