痛風最重要的生化基礎是高尿酸血癥。正常成人每日約產生尿酸750mg，其中80％為內源性，20％為外源性尿酸，這些尿酸進入尿酸代謝池（約為1200mg），每日代謝池中的尿酸約60％進行代謝，其中1/3約200mg經腸道分解代謝，2/3約400mg經腎臟排洩，從而可維持體內尿酸水平的穩定，其中任何環節出現問題均可導致高尿酸血癥。
1、原發性痛風
多有遺傳性，但臨床有痛風家族史者僅佔10％～20％。尿酸生成過多在原發性高尿酸血癥的病因中佔10％。其原因主要是嘌呤代謝酶缺陷，次黃嘌呤鳥嘌呤磷酸核糖轉移酶（HGPRT）缺乏和磷酸核糖焦磷酸鹽（PRPP）合成酶活性亢進。原發性腎臟尿酸排洩減少約佔原發性高尿酸血癥的90％，具體發病機制不清，可能為多基因遺傳性疾病，但應排除腎臟器質性疾病。
2、繼發性痛風
指繼發於其他疾病過程中的一種臨床表現，也可因某些藥物所致。骨髓增生性疾病如白血病、淋巴瘤、多發性骨髓瘤、紅細胞計數增多症、溶血性貧血和癌症等可導致細胞的增殖加速，使核酸轉換增加，造成尿酸產生增多。惡性腫瘤在腫瘤的放化療後引起細胞大量破壞，核酸轉換也增加，導致尿酸產生增多。腎臟疾病包括慢性腎小球腎炎、腎盂腎炎、多囊腎、鉛中毒和高血壓晚期等引起的腎小球濾過功能減退，可使尿酸排洩減少，導致血尿酸濃度升高。藥物如噻嗪類利尿藥、呋塞米、乙胺丁醇、吡嗪醯胺、小劑量阿司匹林和煙酸等，可競爭性抑制腎小管排洩尿酸而引起高尿酸血癥。另外，腎移植患者長期服用免疫抑制劑也可發生高尿酸血癥，可能與免疫抑制劑抑制腎小管排洩尿酸有關。
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