少精子症本身無明顯症狀，往往是因婚後夫婦不育就醫而被發現。當有引致精子數量減少的相關疾病存在時，可出現相關的症狀。如精索靜脈曲張時可有陰囊墜脹；前列腺炎時可見尿餘瀝不盡，腰骶部墜脹等；精囊炎時可見血精；睪丸炎時睪丸疼痛等症狀。
對於有生精障礙的人來說，精子計數可能受各種客觀因素的影響，同一個體在不同的時間和不同環境下，精子計數會出現不同的結果。這些影響因素包括檢驗誤差、病人禁慾時間、身體狀況、精神因素等。因此，留取標本，仍需要間隔一定的時間（一般3～7天）。而且應該連續檢查3次以上方可作出結論。同時，在判斷病人生育能力時，應該將精子成活率、精子活動力、精子畸形率等各項指標綜合加以考慮，以免誤診。精液分析化驗是鑑定男子生育能力的必須的重要方法。要想使精液化驗結果真實可靠，一定要注意精液採集的方法、儲存精液的環境溫度、射精後的時間等影響。這些因素均可使精子數量、存活率、活動率發生變化，造成化驗結果失實。
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