目前絕大部分胃潰瘍患者通過藥物治療，就能達到治癒，無需通過手術治療。藥物治療能控制症狀，促進潰瘍癒合，預防復發及避免併發症。
目前臨床上最常用的藥物分為以下幾類：
1、抑制胃酸分泌藥：主要有H2受體拮抗劑和質子泵抑制劑兩類。H2受體拮抗劑常用有西咪替丁、雷尼替丁、法莫替丁和尼扎替丁等；質子泵抑制劑常用有奧美拉唑、蘭索拉唑、雷貝拉唑、埃索美拉唑、艾普拉唑等。
2、胃黏膜保護劑：與抑制胃酸分泌藥聯合應用後，可提高潰瘍癒合質量，減少潰瘍復發，常用有硫糖鋁、膠體鉍，枸櫞酸鉍鉀、米索前列醇等。
3、胃腸動力藥：主要用於出現噁心、嘔吐、腹脹等症狀的患者以促進胃腸排空，緩解症狀。常用有嗎丁林等。
4、根除幽門螺旋桿菌藥物：目前無單一藥物可有效根除幽門螺旋桿菌，須聯合用藥，方能提高幽門螺旋桿菌根除率。常用有克拉黴素、阿莫西林、甲硝唑(或替硝唑)、四環素、呋喃唑酮、某些喹喏酮類如左氧氟沙星等。
胃潰瘍規範化治療的療程一般為4-6周，部分需要維持8周，前2週一般為根除幽門螺旋桿菌的治療，隨後繼續予以抑制胃酸分泌及保護胃黏膜的藥物鞏固治療。
得了胃潰瘍，大部分病人一般經內科治療能夠治癒，不需要手術治療。只有在以下情況下才需行手術治療：潰瘍大出血藥物不能控制；潰瘍穿孔；瘢痕性幽門梗阻；藥物治療無效的難治性潰瘍；潰瘍高度懷疑癌變。
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