接種乙型肝炎疫苗是預防HBV 感染的最有效方法。乙型肝炎疫苗的接種物件主要是新生兒，其次為嬰幼兒,15歲以下未免疫人群和高危人群 (如醫務人員、經常接觸血液的人員、托幼機構工作人員、器官移植患者、經常接受輸血或血液製品者、免疫功能低下者、易發生外傷者、HBsAg 陽性者的家庭成員、男性同性戀或有多個性伴侶和靜脈內注射毒品者等)。乙型肝炎疫苗全程接種共3 針，按照0、1、6 個月程式，即接種第1 針疫苗後，間隔1 及6 個月注射第2 及第3 針疫苗。新生兒接種乙型肝炎疫苗越早越好，要求在出生後24 h 內接種。接種部位新生兒為大腿前部外側肌肉內，兒童和成人為上臂三角肌中部肌肉內注射。單用乙型肝炎疫苗阻斷母嬰傳播的保護率為87.8% [26] (Ⅱ-3)。山東省千佛山醫院肝病科安勇
對HBsAg 陽性母親的新生兒，應在出生後24 h 內儘早注射乙型肝炎免疫球蛋白 (HBIG)，最好在出生後12 h 內，劑量應≥100 IU ，同時在不同部位接種10 μg 重組酵母或20μg 中國倉鼠卵母細胞 (CHO) 乙型肝炎疫苗，在1個月和6個月時分別接種第2針和第三針乙型肝炎疫苗，可顯著提高阻斷母嬰傳播的效果(Ⅱ-3)。也可在出生後12 h 內先注射1 針HBIG，1 個月後再注射第2 針HBIG，並同時在不同部位接種一針10 μg 重組酵母或20μg CHO 乙型肝炎疫苗，間隔1 和6 個月分別接種第2 和第3 針乙型肝炎疫苗。新生兒在出生12 h 內注射HBIG 和乙型肝炎疫苗後，可接受HBsAg 陽性母親的哺乳[29] (III)。
高病毒載量孕婦所生新生兒感染HBV的危險性增高。有報道認為，在HBVDNA大於109拷貝/毫升的孕婦，自妊娠32周開始給孕婦拉米夫定抗病毒治療至出生1個月，可以減少母嬰傳播的風險。但在取得更充分的證據前尚不能給出明確推薦意見。
對HBsAg 陰性母親的新生兒可用5μg 或10μg重組酵母或10μg CHO 乙型肝炎疫苗免疫；對新生兒時期未接種乙型肝炎疫苗的兒童應進行補種，劑量為5μg或10μg 重組酵母或10μg CHO 乙型肝炎疫苗；對成人建議接種20μg 重組酵母或20μg CHO 乙型肝炎疫苗。對免疫功能低下或無應答者，應增加疫苗的接種劑量（如60μg）和針次；對3 針免疫程式無應答者可再接種3 針，並於第2次接種3 針乙型肝炎疫苗後1~2 個月檢測血清中抗-HBs。如仍無應答，可接種一針60μg重組酵母乙型肝炎疫苗。
接種乙型肝炎疫苗後有抗體應答者的保護效果一般至少可持續12 年，因此，一般人群不需要進行抗-HBs 監測或加強免疫。但對高危人群可進行抗-HBs 監測，如抗-HBs< 10 mIU/ml ，可給予加強免疫[30] (Ⅲ)。
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