吸菸的危害很多，吸菸產生的煙霧中有近2000種有害物質，如尼古丁、氰氫酸、一氧化碳和一些重金屬元素，有40多種致癌物，如聯苯胺及煤焦油等。其中，尼古丁的含量最多且毒性最大，許多資料表明，開始吸菸的年齡越小，受害程度也越大，死亡率也越高。
如果你吸菸，就會注意到許多問題逐漸顯現。比如，味覺和嗅覺將會變弱，感冒會比以前更頻繁，臉上的皺紋會變深，還會得惱人的“吸菸者的咳嗽”，它事實上是慢性支氣管炎的一個症狀。同時，也會使肺癌、肺氣腫、高血壓、中風和心臟病的機率上升。還會讓你的家人吸第二手菸，帶給他們相同的健康風險
個人越早開始吸菸，那他戒掉煙的可能性越小。嘗試行為很快轉變成喜歡，隨後便沉溺於尼古丁，讓吸菸者一直被煙勾引住。
除了使人上癮的物質尼古丁外，菸草中另外的主要有害物質是焦油和一氧化碳。焦油可聚集在肺中形成黏性、棕褐色殘餘物焦油主要由一種被稱作碳氫化合物的化學物質組成，與肺癌的發生有關，是一種很強的致癌因子。一氧化碳是一種有毒物質，能替代部分在正常情況下被紅細胞載送到全身的氧氣，使身體沒有足夠的氧氣。改抽低焦油雪茄是沒有用的，因為人們經常性會以更長的吸入或吸更多的煙來補償這一改變。
吸菸是肺癌最大的誘因，國內外資料表明，吸菸者的肺癌發病率是不吸菸者的15~30倍。
吸菸同時也是心臟病的主要原因，它通過降低血液中“有益膽固醇”高密度脂蛋白(HDL)來促使心臟病的發生。此外，吸菸還對運送心臟血液和營養物質的動脈有不利影響。吸菸者得心臟病的機率是不吸菸者的2倍
男性吸菸還會導致陽痿，這是因為，菸草中的尼古丁、一氧化碳和焦油中的蘆丁蛋白等有害物質能使陰莖動脈發生粥樣硬化進而使供應陰莖的血液量顯著減少，導致陰莖無法勃起。
吸菸對男性泌尿生殖系統還存在其他很多影響，抽菸者精子正常值比不抽菸者低。同時，還發現精子畸形率與抽菸數量有關。煙的濃縮物含有致癌物，這種物質也存在於抽菸者的體液裡，精子接受了這種致癌物，容易發生遺傳方面的損害。
此外，吸菸和腎癌之間的關係也越來越引起大家的重視，研究表明，男性腎癌的產生原因較複雜，除與自身生理因素相關外，與菸草、應酬和生活壓力大有很大關係。有臨床研究顯示，吸菸者患腎癌的危險是不吸菸者的2倍，且吸菸時間越久、吸菸量越大，危險性越高，這與菸草中多種有毒物質對機體長期刺激有關。菸草中含有的芳香胺類和丙烯醛等有害物質，進入血液迴圈後經腎臟過濾，然後通過膀胱從尿液排出體外。故吸菸一直被認為是腎癌的中度危險因素，增加的風險較非吸菸者高，且與吸菸量也有明顯關係。
吸菸和膀胱癌的相關關係早已成為業內的共識，研究表明，由於吸菸而導致的膀胱癌佔膀胱癌總數的25％~60％，香菸中含有的芳香胺類物質和對氨基聯二苯等最為有害，多以“無活性代謝”的形式，經尿液排出體外。由作用於膀胱的毒性和致突變性效應而引起菸草中的丙烯醛會引發膀胱上皮的瀰漫性增生，而在1支香菸中含有大約100微克的丙烯醛。被動吸菸的兒童長大後患膀胱癌的危險會增加。研究還發現，吸菸者患膀胱癌的危險是不吸菸者的4倍，而且患膀胱癌的危險隨著吸菸數量的多少和煙齡的長短而有所變化。
吸菸雖不能直接導致前列腺疾病，但與前列腺疾病有密切關係，因為吸菸能使人體免疫力下降。國外學者通過大量實驗研究，一致認為吸菸可降低免疫力。慢性前列腺炎患者病程長，很難治癒，如果仍然吸菸，致使免疫力低下，就會影響病情痊癒。
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