抗核抗體陽性對自身免疫病的診斷、病情判斷、療效評價中具有重要的意義，尤其對診斷具有很高的敏感性，廣泛用於自身免疫病的初步篩查。
首先，嚴格說來，抗核抗體非單一抗體，而是一組具有不同臨床意義的自身抗體組合，也可稱其為抗核抗體譜，如抗雙鏈DNA抗體、抗Sm抗體、抗組蛋白抗體、抗著絲點抗體、抗SSA抗體、抗SSB抗體等。
其次，不同型別的抗核抗體臨床意義各不相同，如抗雙鏈DNA抗體、抗Sm抗體為系統性紅斑狼瘡特異性抗體；抗SSA抗體、抗SSB抗體多見於乾燥綜合徵；抗Scl-70抗體多見於系統性硬化症；抗Jo-1抗體見於肌炎等。
第三，不同型別抗核抗體在相關疾病中的陽性率與特異性存在較大差異。如抗雙鏈DNA抗體、抗Sm抗體均為系統性紅斑狼瘡特異性抗體，但前者陽性率可達60%-90%，而後者陽性率僅20%左右。此外，藥物性因素、感染等可導致抗核抗體陽性。
因此，導致抗核抗體陽性最常見的原因是自身免疫病，但明確診斷還需結合具體症狀體徵。患者一旦出現抗核抗體陽性，應儘早到風溼科就診，請醫生全面分析找尋原因。
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