腎結石導致疼痛多是因為結石在排出過程中，嵌頓於尿路中的某一個狹窄部位，引起平滑肌痙攣，導致腎絞痛發作。可以對症止痛治療、排石治療或取石治療。
首先應該多飲水。使得每天尿量維持在2000-3000ml，配合解除痙攣藥物。尿液稀釋有利於小結石的沖刷和排出，有助於防止復發。
其次要對症止痛治療。根據疼痛程度，選擇不同的止痛藥，通常首先使用非甾體類抗炎藥，如使用吲哚美辛栓肛門塞入。如果疼痛仍不能緩解，則需要選擇弱阿片類鎮痛藥，甚至強阿片類鎮痛藥。弱阿片類鎮痛藥通常選擇曲馬多，強阿片類藥物多選擇哌替啶針，注意在使用阿片類鎮痛藥時一定要使用解痙藥物。解痙止痛的藥如654-2肌注可以緩解平滑肌痙攣。
第三可進行排石治療。直徑小於6毫米的光滑結石，如果結石以下尿路無梗阻，結石未引起完全梗阻，可服用排石沖劑，配合多飲水和適當運動，有助於結石排出。α受體阻滯劑和鈣離子阻滯劑也具有舒緩平滑機、促進腎結石向輸尿管、向膀胱、向體外排出的作用。
如果上述治療無效，則可以考慮體外衝擊波碎石術、輸尿管鏡手術或者經皮腎鏡取石術。總之只有結石排出體外，才能根治腎結石疼痛。
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