房間隔缺損的手術分為常規的開胸手術和經皮介入封堵手術，兩種手術費用不同。
常規的開胸手術適用情況為：房間隔缺損位於特殊部位的患者，一般無法進行封堵術，需進行開胸手術者；房間隔缺損在靠近心臟及其他重要結構部位時，封堵過程中，可能破壞其他組織結構，需在開胸直視下進行手術者。開胸手術費用總共大約在4萬到5萬塊錢，包括術前檢查費、手術費和術後治療費用等。
經皮介入封堵手術為：房間隔缺損開胸手術目前應用逐漸減少，一般採取微創或封堵術。該方法無需體外迴圈，創傷少，適用於繼發孔型且房間隔缺損大小、位置適宜的病人。根據封堵器規格不同具有不同的費用。常規的封堵器治療費用大概是在3萬塊錢左右；陶瓷傘封堵器治療總費用大約在4萬5千錢左右；進口封堵器治療費用差不多在4萬8千塊-5萬塊錢左右。
開胸手術和經皮介入封堵手術分別適用於不同病情的房間隔缺損，雖然有手術費用的差別，但建議優先以病情需要為選擇手術方法的前提。
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