性功能障礙可以發生於男性，也可以發生於女性。性功能障礙的發生主要是由於身體疾病或者心理因素導致的。因此治療性功能障礙主要是治療身體疾病的以及改善心理狀況。
治療身體原因主要是通過一些藥物來治療患者的缺陷，近年來，對於男性勃起障礙的治療已經得到很好的效果，偉哥的出現幫助了勃起障礙的患者找回了自信。射精障礙的治療主要是通過手術切斷神經減少神經衝動的情況，這樣就可以治療男性的性功能障礙，這對於早洩患者有一定的療效。
對於女性來說治療性功能障礙的問題，潤滑凝膠或乳膏或激素療法可以解決陰道乾燥的問題。這樣就解決了女性的身體問題，以減少性生活中的疼痛不適等問題。
治療心理的原因主要是心理諮詢提供的幫助，患者得到心理治療師的幫助改善了自身的壓力的緩解問題，這類治療一般是伴侶一同治療會出現很大的效果，徹底解決了問題。有時，對性行為的支援和教育就是患者所需要的，他們可以在諮詢中解決身體形象和其他抑制問題。對於根深蒂固的性功能障礙，可能需要進行心理治療。
這類疾病一直是人們不能直接面對的，但是時間越長就會導致問題更加嚴重，大多數時候，性功能障礙患者的治療前景非常好。但是克服不了觀念。因此，當患病時，應當及時就診。
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