牙床腫痛後，很大一部分都是由於感染因素所導致的，一般在治療的時候可以選擇一些抗生素治療。抗生素的選擇也是需要合理使用的，主要與發生炎症的口腔環境有關。
選擇抗生素治療主要是選擇甲硝唑、阿莫西林或者一些頭孢類藥物進行治療。甲硝唑一直以來都被認為是治療厭氧菌有效的藥物。阿莫西林、頭孢類藥物都是比較常用的廣譜抗菌藥物。這些藥物不僅價格便宜，臨床常用，也有比較好的效果。
消炎藥物一定要合理選擇。不適當的藥物選擇，可以造成很多的問題。藥物耐藥，主要是由於不正確選擇抗生素，過長時間使用抗生素所導致的。口腔中革蘭氏陽性菌以及厭氧菌導致的感染居多，選擇抗革蘭氏陰性菌的藥物，治療效果就不會好，過多的殺滅了口腔中的一些其他細菌，可能導致另外的一些細菌生長，發生病變時，再使用常用的甲硝唑這些藥物可能就會起不到效果。藥物選擇還要注意是否是過敏的問題，這是合理選擇抗生素的重點，過敏的頭孢類抗生素、青黴素使用，輕者可以出現皮疹瘙癢不適，重者可以危及生命。使用抗菌藥物應當慎重，建議在醫生指導下使用。
口腔是一種相對閉合、能與外界接觸的環境。這種環境中，容易導致厭氧菌和革蘭氏陽性菌的滋生，在某些原因下，盲目使用抗生素會導致較為嚴重的後果，一方面應當諮詢醫生，另一方面口腔區域性治療往往有比抗生素更好的效果。
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