吞嚥障礙是腦損傷後患者的常見併發症，同時吞嚥障礙又會導致一系列併發症，如誤吸和吸入性肺炎、脫水、營養不良。
吞嚥障礙的治療方式大概總結如下：
1、基礎訓練
吞嚥相關肌群運動包括頰肌訓練、喉上提訓練、舌部運動、發音運動訓練、呼吸訓練以及特殊吞嚥技術等。
感覺促進綜合訓練可以採用溫度為8℃的冰塊及檸檬汁對患者咽部交替刺激。
2、直接攝食訓練
選擇的進食環境要安靜，進食的體位可以半臥位，食物的性狀為糊狀及進食一口量，進食前後要保持口腔清潔，最大程度地減少誤吸的發生。
3、針刺治療
針刺是根據祖國醫學辨證論治的原則“經脈所過，主治所及”及腧穴的“穴位所在，主現代醫學理論基礎認為，針刺可以調節自主神經功能和激發與吞嚥有關反射的再建立。通過刺激咽部感受器，引起吞嚥相關肌肉興奮，也使得環嚥肌的痙攣受到抑制。此外，針刺還可以促使頸動脈及椎動脈系統的血供得以改善，促使腦部病灶側支迴圈早期建立，促使損傷的神經功能恢復，從而使吞嚥障礙症狀得以改善。
4、電刺激
目前採用VitalStim系列吞嚥治療儀對患者進行電刺激治療較多，反覆的電刺激吞嚥相關肌肉產生感覺和運動效應，可預防廢用性吞嚥肌萎縮、增加咽部肌肉的運動能力及吞嚥協調性。
5、經顱磁刺激(TMS)
經顱磁刺激通過運動誘發電位來調節運動皮質的興奮性，不同頻率的刺激會對皮質產生不同的興奮或抑制作用，患者在2個月時出現了較顯著的吞嚥改善，故其認為經顱磁刺激可作為腦損傷後吞嚥障礙的常規輔助療法。
6、球囊擴張
對於表現為咽與食管上括約肌(UES)運動協調不能而導致的吞嚥障礙，多采用球囊擴張術。
7、其他
運動想象療法與神經肌肉電刺激聯合治療腦卒中後吞嚥障礙的療效，其誘導患者想象正在慢慢咀嚼自己最想吃的美食，而條件反射會使唾液分泌增加。
吞嚥障礙患者的心理治療也應該得到重視，應儘早採取心理干預及健康教育，鼓勵患者樹立起戰勝疾病的信心。此外，肉毒毒素注射治療環嚥肌痙攣也取得顯著療效。
對於腦損傷後吞嚥障礙的患者，應該儘早評定，康復早期介入，及早實施個性化康復治療方案及綜合治療，最大限度地減少併發症，使得患者的生命質量得以提高。
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