妊娠期亞臨床甲減對胎兒神經智力發育的影響尚不明確。一項大規模的病例對照研究結果表明，與甲狀腺功能正常的孕婦相比，未經治療的亞臨床甲減孕婦的後代智商評分降低7分，7歲到9歲的兒童運動、語言和注意力發育遲緩。中國醫科大學課題組的一項回顧性研究獲得了相同的結論，篩查來自1268例16-20周孕婦的血清，獲得單純亞臨床甲減（FT4、TPOAb正常）18例、正常孕婦140例，對她們後代在出生後25-30個月時進行隨訪，MDI和PDI較正常對照組分別減低9.98和9.23分差異有統計學意義。薛海波等分析妊娠婦女TSH升高的程度與兒童智力發育的關係發現：TSH>=3.93mIU/L孕婦後代的MDI和PDI顯著降低而2.5mIU/L<TSH<3.93mIU/L孕婦後代的上述評分與正常對照組沒有顯著差別特異參考範圍的上限（3.93mIU/L），而不應當是2.5mIU/L。最近發表的CATS研究結果顯示,對390例亞臨床甲減或者低T4血癥妊娠婦女，在平均12周3天時啟動L-T4(150ug/d）干預，測定她們出生後代3歲時的智商，與未乾預組（n=404）比較沒有顯著差別。陰性結果可能與2個原因有關：（1）妊娠12周啟動干預時間過晚；（2）孕婦亞臨床甲減程度較輕，TSH中位數平均3.8mIU/L（對照組為3.2mIU/L）。
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