1、神經內鏡正在替代顯微鏡成為垂體瘤的最佳手術方式
通過開顱手術-------經口-鼻-蝶手術--------經單鼻孔手術----------單鼻孔神經內鏡手術
垂體瘤的手術創傷越來越小，術中可以更多保護鼻粘膜，鼻中隔，減少鼻中隔穿孔;內鏡深入蝶竇內，腫瘤得到更全切除，而正常垂體功能得到有效保護，術後出現尿崩症這一複雜危險增加病人痛苦、延長病人住院時間、增加經濟費用的併發症，神經內鏡的應用使得之一併發症得到顯著減少。
2、很多腦積水患者可以避免終身帶管和各種帶管併發症
過去腦積水患者，需要腦室-腹腔分流術治療，需要一根分流管自腦室通過皮下隧道送人腹腔，終身帶管，可能發生管腔堵塞、感染、過度分流、分流不足、分流失效等情況。
腦室鏡可以通過額部的小骨孔將內鏡送入腦室內，通過內鏡內器械腔道使用器械開啟三腦室底部造瘻，使腦脊液越過梗阻區。病人將不需要進行分流手術及終身帶管。也不會發生一系列帶管的併發症。
3、腦室疾病：腦囊蟲病、腦室腫瘤等。
4、蛛網膜囊腫
相對於顯微鏡手術，使用神經內鏡創傷更小，骨窗小，效果更好;相對於分流手術，更可靠，費用更低，更符合病人腦脊液的自然迴圈。
5、許多顯微手術的替代或配合協作
由於光學原理，顯微鏡下視野較小，深部組織的側面後面是視野死角，會導致病變遺漏、判斷不準確，因而效果不理想。如動脈瘤夾閉遺留瘤頸、夾閉不全，微血管減壓術遺漏責任血管等。另外，神經內鏡可以更加微創治療腦出血這一常見疾病，創傷更小，效果更好。
神經內鏡可以提供更好的近照明和更清晰的影象，更能夠顯示更大視角，不同角度的內鏡還可以觀察到側方和後方，可以一定程度上替代或協作顯微鏡下手術，為患者提供更好的手術效果。
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