骶髂關節類風溼性關節炎和骶髂關節結核的早期以及二者發生骨性強直階段在X線片上鑑別均比較困難。類風溼性關節炎和結核早期均可有骶髂關節面破壞，表現為關節面不整和輪廓模糊，繼之則可出現關節腔狹窄，甚至發生關節骨性強直。
在鑑別診斷方面下列幾點可供參考：
1、結核多侵犯單側骶髂關節，而類風溼侵犯兩側骶髂關節居多，但病變程度可不對稱。
2、骶髂關節結核由骶骨結核或髂骨結核發展而來，因此，儘管骶骨和髂骨均可受侵犯，常以某一骨破壞更為顯著。而類風溼性骶髂關節炎兩骨受累的程度差別不明顯。
3、骶髂關節結核易形成膿腫，髂骨破壞嚴重者，膿腫多在背部或臀部出現。骶骨破壞嚴重者膿腫多侷限於盆腔髂腰肌部位。病變已使骶髂兩骨均遭明顯破壞時，膿腫則可能同時發生在背部、臀部和盆腔。
4、骶髂關節結核可與其他結核(肺、腎......)同時並存，而類風溼則可與其它關節類風溼並存(脊柱、四肢關節)。
除這兩種疾病之外，有類似表現者還有骶髂關節布氏桿菌病，此時應注意居住地區、職業、化驗檢查和其它症狀。
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