強直性脊柱炎骶髂關節疼痛特點是休息不能緩解，活動後方能緩解，這也是與腰椎間盤突出、腰椎管狹窄、腰部外傷的區別點。強直性脊柱炎輕症者,僅會感覺骶髂關節部僵硬、肌肉痠痛。原因是肌腱、韌帶與骶髂關節的骨附著點炎症，即肌腱末端炎。易誤診為腰椎間盤突出、風溼病。臀、大腿後側疼痛易誤診為坐骨神經痛，但是強直性脊柱炎引起的下肢疼痛很少放射到膝以下。
強直性脊柱炎交替性左右骶髂關節部位疼痛，是強直性脊柱炎中、早期最具特徵性的症狀。是骶髂關節固定部位深層次隱漸性疼痛，先為一側顯著，後發展為左右交替性疼痛，重者痛處在骶髂關節一點上。骶髂關節疼痛可以上移出現腰椎部疼痛，下移至坐骨疼痛或大腿髂部痛，因咳嗽、打噴嚏或其他牽動性動作而疼痛加重。開始時疼痛可以為單側、間歇性，幾個月後逐漸發展為雙側、持續性疼痛並伴有腰部僵硬。
強直性脊柱炎都侵犯骶髂關節，上行至腰椎疼痛，所以強直性脊柱炎骶髂關節疼痛常伴有腰痛和腰骶疼痛伴有晨僵。先為反覆發作，間歇性或兩側交替性痠痛，隨病情發展，或持續性深部隱漸性鈍痛或者刺痛，伴有腰部痠痛，全身疲勞無力，其特點為休息、陰天或勞累後加重，活動、遇熱後疼痛緩解。
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