男性不育症治療前必須明確：睪丸、附睪、輸精管是否有問題，男方的精液情況是否正常等，並明確病因，針對不同病因採取不同措施，同樣需要指出的是，也有很大一部分的患者查不出病因，為特發性若少精子症。
對於女精液質量異常的患者，應明確具體的病因，做相關檢查如精漿生化、內分泌、染色體等。對於睪丸、附睪、精囊腺等炎症者，可採用消炎藥物;對於雄激素低下者，可補充雄激素，對泌乳素高者，可予溴隱亭治療。男性不育症的手術適應症常為輸精管道阻塞，如射精管阻塞、附睪阻塞、精索靜脈曲張、隱睪等。對於精子數量極少的患者，在藥物治療和手術治療無效的情況下，可考慮輔助生殖技術，包括常用的人工授精(由丈夫精液人工授精、供者精液人工授精等)、各種試管嬰兒技術等。當然，在精子密度達標的情況下，對部分弱精子症、免疫性不育症患者可採用體外精液優化技術，再實施夫精人工授精。
特別指出的一點是：
現在試管嬰兒技術已發展到可以實施“卵泡內單精子注射”，只要有數個活動的精子，就有可能獲得數個受精卵，從而使患極少精子的不育症患者獲得治癒的可能。同樣，一個月經週期的輔助生殖技術妊娠的受孕率一般不會超過40％。
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