在不伴有尿道感染的前提下，從患者前列腺液中檢測出大量致病菌是慢性細菌性前列腺炎的特徵之一。最常見的是大腸桿菌，和革蘭陽性細菌。臨床特徵是會陰、下腹、陰莖、睪丸的疼痛，射精不適，直腸和腰背部的疼痛，以及排尿困難，上述症狀至少持續6個月以上，前列腺按摩定位檢查方法是診斷慢性細菌性前列腺炎的金標準。
慢性前列腺炎對性功能的影響很可能與引發的不適感有關。射精疼痛導致患者避免性生活，下腹的疼痛以及下尿路症狀也會對性功能產生反作用，部分病人會發生早洩。一項有關早洩患者的研究發現，56.6％的患者有前列腺炎症，47.8％的患者有慢性細菌性前列腺炎。
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