如果確定膀胱輸尿管反流的嚴重性和臨床症狀需要手術治療， 可以考慮以下幾種常見的手術。 手術的原則大都是一樣的，即建立一段粘膜下的輸尿管通道， 讓輸尿管膀胱介面的解剖恢復正常的解剖。當膀胱充盈後， 尿液擠壓這段粘膜下的輸尿管， 暫時關閉輸尿管的內腔，起到反流的作用。
各手術的效果和成功率相若，為95％-99％。手術的 選擇視乎醫生的經驗。 醫生採用個人經驗多的術式，病發症的機率自然少些。
術式分類:
膀胱內(intravesical) 輸尿管再植. 開啟膀胱後，橫斷輸尿管，然後遊離一段輸尿管， 建立一個黏膜下通道， 將輸尿管放置在黏膜下， 輸尿管出口在通道的出口重新吻合。輸尿管出口是用原出口的方法為Politano-Leadbetter 氏手術，用新出口的為Cohen 氏手術(經三角區，cross-trigonal ), 或 Glen-Anderson 氏手術 (新出口接近尿道內口)。手術需要切開膀胱， 有一個新的吻合。
這些方法，特別是Cohen氏手術，在國內，香港，英國和澳洲(前英聯邦國家)流行。這類手術最擔心的併發症輸尿管吻合口狹窄和遊離後的輸尿管扭轉或曲折。由於切開了膀胱，術後需要插尿管，會有幾天的血尿。 術後2-3天可以出院。
膀胱外手術
(extravesical), 又名Lich-Gregoir 氏手術。 手術切開一段逼尿肌，用其包埋一段輸尿管， 也同樣的建立了一段黏膜下輸尿管的抗返流機制。好處是不必切開膀胱，也不必重新吻合輸尿管。 破壞性較小。 這術式在美國和一些歐洲國家較流行。 由於沒有切開膀胱，沒有切斷輸尿管，這就避免了輸尿管的扭曲和狹窄。 一般孩子1-2天后可以出院。因為切開了逼尿肌，術後一小部分孩子(特別是做了雙側手術的)，膀胱功能恢復的慢些，需要尿管2-3天。
微創手術：
以上兩種方法傳統的方法是經下腹的一個橫切口進入的開放性手術。香港中文大學的教授楊重光創立了個用腹腔鏡的微創Cohen氏手術方法，即氣膀胱技術 (pneumovesicum)。我2006-08年間在中大工作時，跟他學了不少。 Lich-Gregoir 氏手術現在也可以用腹腔鏡做。
目前一些西方國家，特別是美國，用機器人(達芬奇)輔助腹腔鏡做這些手術開始流行， 做的最多的是 Lich-Gregoir 氏手術。 我們也開始用機器人做Lich-Gregoir氏手術，我個人覺得在盆腔裡縫合，機器人還是有精準的優勢。微創的傷口小一些，恢復的應快些。當然對於一個新的技術，每個人，由於個人經歷不同，都會有不同的看法，這是很自然的。只有經過時間的考驗才能做出最終的判斷。
低度的反流， 在國外也可以考慮通過膀胱鏡輸尿管出口黏膜下注射一種填充物質，成功率略低，53％-87％。 最流行的是一種商品名為Deflux的填充物，目前國內沒有。這治療的 方法的優勢是沒用傷口，孩子可以當天出院。2-5年後的複發率為13％(Lackgren 2001)。
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