在評估甲狀腺結節良惡性方面，CT和MRI檢查不優於超聲。擬行手術治療的甲狀腺結節，術前可行頸部CT或MRI檢查，顯示結節與周圍解剖結構的關係，尋找可疑淋巴結，協助制定手術方案。為了不影響術後可能進行的131I顯像檢查和131I治療，CT檢查中應儘量避免使用含碘造影劑。
18F-FDGPET顯像能夠反映甲狀腺結節攝取和代謝葡萄糖的狀態。並非所有的甲狀腺惡性結節都能在18F-FDGPET中表現為陽性，而某些良性結節也會攝取18F-FDG[17]，因此單純依靠18F-FDGPET顯像不能準確鑑別甲狀腺結節的良惡性。
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