大多數專家的觀點是藥物治療效果不佳的患者可以考慮外科手術治療，手術前需經過詳細術前定位評估適合做手術的病例方可進行外科手術治療。一部分患者經術前評估能發現癲癇病灶，可以行癲癇病灶切除，沒有找到明確的癲癇病灶或癲癇病灶不能切除的患者可以行姑息性手術。
癲癇外科手術已有100多年的歷史，但直到20世紀80年代才逐漸被人們重視。在過去，癲癇患者常常接受長達數年甚至10餘年的藥物治療失敗後才考慮接受外科手術。目前的觀點認為，用藥物進行規範治療失敗後，對於適合手術的患者而言，越早進行手術治療，手術效果越好。所以，目前廣泛採用的方法是，在經過正規使用2-3種合適的抗癲癇藥物治療1-2年，發作仍難以控制時，就可以考慮手術治療。
但是對於以前未經過正規診斷和規律藥物治療的患者，要調整治療方案後再進行藥物規範治療，觀察一段時間再做決定。
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