藥物治療是癲癇患者首選的治療方法，而對於那些難以用藥物控制的頑固性或難治性癲癇患者可考慮手術治療，但手術治療需有嚴格的手術指徵。一般需要進行嚴格的術前評估，需要神經外科、神經內科或小兒神經專科、影像科等多學科會診、協作。
手術選擇的物件是：
1、頑固性癲癇病人；
2、部分性發作的病人；
3、可以手術切除的腦病理性改變；
4、年齡在14-40歲之間；
5、智商不低於60分的患兒。
手術治療可使50％左右的患者停止發作或發作減少，但患者術後仍需服用抗癲癇藥物1-2年，若無癲癇發作，腦電圖正常後，方可逐步減量，而某些部位的手術還可能會出現偏癱 、偏盲、失語等術後併發症，因此是否採用手術治療必需遵守嚴格的手術適應症和手術指徵。對於年齡幼小腦發育尚不成熟者及有明顯精神症狀者，如偏執狂、憂鬱症、 精神分裂症等和病人智商低於60分者，不宜考慮手術。
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