對HBV患者進行抗病毒治療的目的是防止進展為肝硬化及HCC。已有充分的循證醫學證據表明，即使已進展至肝硬化，抗病毒治療仍可讓患者獲益。具體表現為病毒載量下降、炎症減輕，甚至肝臟組織病理學上也可見纖維化甚至肝硬化不同程度的改善,失代償的表現減少。因此，即使患者已經進展到肝硬化，也應該很明確地建議患者進行抗病毒治療，而且越早越好。肝硬化包括代償期和失代償期，無論患者處於哪個階段都應該接受抗病毒治療，從而達到使患者保持目前階段甚至逆轉肝硬化進展的治療目的。武漢協和醫院感染科魏屏
目前可以肯定的是，當CHB患者已存在肝纖維化時，抗病毒治療與否的臨床結局是有差異的。抗病毒治療能夠明顯減緩肝纖維及肝硬化的進展，減少失代償及HCC的發生。當患者已有纖維化及肝硬化時，也同樣需要抗病毒治療。治療早期能觀察到如HBV DNA載量降低及ALT復常等指標改變，同時也需要長時間治療來達到纖維化逆轉及肝硬化部分程度逆轉。
不同的核苷（酸）類似物對於肝炎肝硬化患者的治療都有一定作用，可表現為病毒載量下降、ALT復常及肝臟組織學改善等。但是對不同種類的核苷（酸）類似物的對比研究發現，藥物的療效是存在差別的。如，恩替卡韋（ETV）治療1年後HBV DNA檢測不到的比率顯著高於使用拉米夫定（LAM）的患者；使用ETV的患者ALT復常率也要高於使用LAM的患者；在耐藥方面，應用ETV後1年或6年耐藥率也顯著低於使用LAM的患者。當患者已經存在肝炎肝硬化時，需要長時間甚至終身服藥治療，因此選擇低耐藥率藥物是非常重要的。
因此，對肝炎肝硬化的患者，首選抗病毒療效好且耐藥發生率低的藥物。當然在治療的過程中要進行密切的監測，不僅監測療效也要監測耐藥及其他不良反應。這樣才能通過治療讓患者長期獲益。
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